Comparación de diferentes sondas de DNA para la detección de Plasmodium falciparum

Resumen

Las sondas pRepHind, Rep20, p242B1-1, pPF-14, clon 26 y clon 34 se compararon a fin de examinar su capacidad para detectar P. falciparum en estudios de campo. Noventa y cuatro muestras de pacientes procedentes de Tumaco, región endémica de malaria situada en la Costa Pacífica Colombiana y 78 muestras provenientes de Villavicencio (Llanos Orientales), se estudiaron en experimentos de hibridación en "dot-blot". Las sondas Rep 20, p242B1-1, pRepHind y pPF-14 detectaron hasta 17 pg de DNA purificado de P. falciparum, mientras que los clones 26 y 34 detectaron 425 pg de DNA. Las sondas pPF-14, p242B1-1, pRepHind y Rep 20 mostraron niveles comparables de detección en muestras de sangre infectada. La sensibilidad mostró variaciones desde 75-94% en sujetos con parasitemias mayores de 10.000 par. a 15-42% en sujetos con parasitemias menores de 100 par. .Las sondas pPF-14 y p242B1-1 mostraron la mayor sensibilidad, mientras que los clones 26 y 34 presentaron niveles de detección significativamente menores. Todas las sondas demostraron ser altamente específicas. Los niveles de detección fueron dependientes del tratamiento de la muestra. El tratamiento consiste en eliminación del suero, lisis con Triton X-100, digestión con Proteinasa K, extracción con Fenol y Cloroformo, y precipitación con etanol condujo a niveles de detección del 100% cuando se realizó en muestras con parasitemias igual y/o mayores de 1.000 par.