Análisis de la variabilidad genética de la población de Bogotá: hacia la constitución de un mapa haplotípico

Juan David Caicedo, Alejandro Cáceres, Carlos E. Arboleda-Bustos, María Fernanda Mahecha, Jenny Ortega, Gonzalo Arboleda, Humberto Arboleda, .

Resumen

Introducción. Los proyectos del HapMap y de los 1000 Genomas han sido fundamentales para la compresión del componente genético de las enfermedades comunes y los fenotipos normales. No obstante, la variabilidad genética colombiana incluida en estos proyectos no es representativa de nuestro país.

Objetivo. Contribuir al conocimiento de la variabilidad genética de la población colombiana a partir del estudio genómico de una muestra de individuos de Bogotá.

Materiales y métodos. Se genotipificaron un total de 2.372.784 marcadores genéticos en 32 individuos nacidos en Bogotá y con padres originarios de la misma región utilizando la plataforma Illumina. Los niveles de la variabilidad genética fueron determinados y comparados con los datos disponibles de otras poblaciones del proyecto de los 1000 Genomas.

Resultados. Los individuos de Bogotá analizados presentaron una variabilidad genética semejante a las poblaciones con las que comparten ancestría. No obstante, a pesar de la baja diferenciación genética detectada entre la población de Bogotá (CLB) y la de Medellín (CLM), el análisis de PCA sugiere una composición genética diferente entre ambas poblaciones.

Conclusiones. Nuestro análisis genómico de la muestra de Bogotá nos permitió detectar similitudes y diferencias con otras poblaciones Americanas. El aumento de la muestra bogotana y la inclusión de muestras de otras regiones del país nos permitirán tener una mejor compresión de la variabilidad genética presente en Colombia, fundamental paraestudios de salud humana, prevención y el tratamiento de las enfermedades comunes en nuestro país.

Descargas

La descarga de datos todavía no está disponible.
  • Juan David Caicedo Grupo de Neurociencias, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, D.C. Colombia
  • Alejandro Cáceres Instituto de Salud Global de Barcelona, Barcelona, España
  • Carlos E. Arboleda-Bustos Grupo de Neurociencias, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, D.C. Colombia
  • María Fernanda Mahecha Grupo de Neurociencias, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, D.C. Colombia
  • Jenny Ortega Grupo de Neurociencias, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, D.C. Colombia
  • Gonzalo Arboleda Grupo de Neurociencias, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, D.C. Colombia
  • Humberto Arboleda Grupo de Neurociencias, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, D.C. Colombia
Cómo citar
Caicedo, J. D., Cáceres, A., Arboleda-Bustos, C. E., Mahecha, M. F., Ortega, J., Arboleda, G., & Arboleda, H. (2019). Análisis de la variabilidad genética de la población de Bogotá: hacia la constitución de un mapa haplotípico. Biomédica, 39(3). https://doi.org/10.7705/biomedica.v39i4.4753

Más sobre este tema

Publicado
2019-02-22